夏允彝和陈子龙刚中了崇祯十年的三甲进士，因为家庭原因并没有前往远方赴任务，青枫举荐云间三子为国效力。
陈子龙为上海知县，夏允彝为华亭知县，李瑞和为松江同知，宋征舆和李雯分别为上海县和华亭县的主簿；同时决定柳如是在松江建立新式学堂，松江大学堂西学为主，儒学为辅，诸子百家均可入住；李岩在松江设立海军大学堂和上海医院。
提议松江府兵制改革，废除苏州卫、嘉兴中左千户所、太仓卫、吴淞江千户所、宝山千户所、 镇海卫、崇明沙千户所、金山卫、青村中前千户所、南汇嘴中后千户所、松江中千户所。设立东部镇军，驻扎于上海县和崇明岛，兵力由原来的三万人缩减为一万，预估每年给朝廷减少兵饷十万两，给地方减轻负担二十万两，一时间所涉及州县纷纷表示赞同。
北京御书房内，崇祯盯着青枫的折子久久没有移开，他将折子放下，然后又拿起，就这样重复了数次。
崇祯皇帝看到卓清枫的推荐以及改革方案后，对于任命没有异议，只是这兵制改革不知何意？自己一时间也拿不下注意，于是吩咐小太监喊来了王承恩。
崇祯将折子递了过去，严肃的说道：“你看这个小子到底又想搞什么，朕发现自己越来越看不懂这小子，礼制改革还能明白，还能容忍，这兵制就……？”
“嗯，以老奴之见，这些个卫所其实只是尸位素餐罢了，军官贪污腐化严重，下层军户逃亡达到七层以上，这些裁撤卫所实际上的兵也就一万罢了。卓大学士所言极是，卫所之兵，眼下已经成为了各地卫所的百户、千户、守备、游击、参将的私兵，只吃不干事的东西，还经常骚扰地方，不如打乱卫所，从新练兵，或许能够提升军队战力。”
“我大明的卫军，有你个老东西说的这么严重，朕倒是从来没有关心过南直隶的卫所，这些兵对朕来说，仿佛从来没有过似的，或许没有更好，省的朕为那些卫所军官操心。”崇祯暗自纳闷，这些兵还真是只吃不干。
“老奴说个实事，嘉靖三十四年（公元1555年），有五十三名来自日本的倭寇，在浙江和南直隶各地大纵深窜犯游击。朝廷地方卫所之军和巡检衙役民兵等，多次以绝对优势兵力围剿失败，竟然让这五十三人，无法无天到围攻南京城两天。”
“什么，竟有此事，为什么朕从未听说？”崇祯一脸惊讶，卫所之军无能，自己早已知晓，万万没想到无能到这种地步。
“嘉靖爷时的旧事，又不是好事，谁敢在皇上耳边提起。”
“后来呢，这些倭寇有没有剿灭？”崇祯急切的追问。
“倭寇在不损一人的情况下，搏杀了近千朝廷军，并大摇大摆、全身而退。皇上，你说这样的军队还有什么战力，不夸张的说，陕西剿匪的任何一路边军一万可以杀的这些卫所军队几十万大军到处跑。”王承恩再次恭恭敬敬的说着，偶尔抬头看看崇祯复杂的表情。
“算了，你也不用说这些事情，朕的头好疼，不过朕只记得，他青枫说了，东部镇军不用卫所制度，也不要朕的一分钱，而且每年还给朕节省十万两饷银。只要不问朕要钱，就随他去试点吧！”崇祯烦透了这些事情，他最喜欢的就是给他送钱的奏折。
“皇上，这一万兵朝廷难道就不派监军看着，万一和左良玉他们一样，练兵练成了私兵，可就不好办了。”王承恩秉着对崇祯的忠心提醒。
“让他们先练兵吧，总不能还没干事，朕就派去个监督的，总是有些不好，等他们练个一年，朕再派监军，这样也好说话。”
崇祯十一年十月，在崇祯皇帝的圣旨没有到达之前，襄阳镇军由李岩、红娘子带领两镇军队秘密乘船抵达上海，在镇军吹枯拉朽之势下，苏州松江各地卫所改革进行的异常顺利，最后所有卫所的实际兵员也只有一万人，所带来的两镇改为镇军东部镇军第一镇和第二镇，卫所军队被整编为东部镇军第三镇，由李岩代管，黄石东担任镇军副总兵。
襄阳的两镇辅兵升格为西部镇军第二镇、第三镇由左岩担任总兵，牛金星担任第二镇副总兵，宋献策担任第三镇副总兵，原刘溪所领第三镇改为第一镇，仍由刘溪担任总兵。河南陕西湖北逃来的流民重新整编为三镇辅兵分别由李冰、吴三地、何志奎担任总兵。
所有的兵力整合完毕，青枫决定带领文忠、李岩带领第一镇前往苏北、山东、河北看看情况，顺便召集一些流民或者北方大族迁移到上海，此次作战目的不是打仗，而是练兵，最主要想看看鞑子的战力究竟如何？
同时青枫给皇帝请旨，带领新建镇军北上勤王，援助大明总督、领衔兵部尚书卢象升。崇祯大喜，不管如何，总是好事，所有的总兵都避而远之，青枫却主动带领新编镇军前往支援，实是大明忠臣。
崇祯十一年八月二十三日，皇太极命睿亲王多尔衮为奉命大将军，统左翼军，贝勒岳托为扬武大将军，统右翼军，贝勒杜度等相副，两路征明。
九月二十二日，岳托从密云北边墙子岭，毁坏长城，破边墙入边，斩杀明蓟辽总督吴阿衡。多尔衮则于九月二十八日于青山关毁边墙而入，两军在北京郊区通州会师。崇祯诏令总督宣、大、山西军务的卢象升，携宣、大、山西三总兵杨国柱、王朴、虎大威入卫京师。以卢象升督天下援兵，第三次赐尚方剑。
当时崇祯已经有和议的意愿，让兵部尚书陈新甲和清朝在私底下接触。大学士杨嗣昌、总监军太监高起潜揣测到了崇祯意在和议，对卢象升多方阻挠，卢象升名为总督天下兵马，但根本调动不了其他人的兵马，他定下的几条用兵策略一条也没法实现。
由于卢象升总督宣、大、山西军务时，宣、大、山西三总兵吃空饷吃得太狠，相比日后杨国柱、王朴参与的松锦之战，八总兵十三万，这次三总兵竟不到两万人。因数量不及来援关宁军，结果关宁军宦官监军高起潜不愿接受卢象升指挥。
崇祯见此，改用内阁首辅刘宇亮节制天下援军。 卢象升只能统领自己的宣、大、山西三总兵，关宁军则宦官监军高起潜指挥。因此卢象升虽一度名义上总督天下援兵，实际上不到两万。
卢象升由涿州进据保定，命令诸将分道出击，在庆都和清军作战。
当时编修（从六品）杨廷麟上疏讥讽杨嗣昌，于是杨嗣昌表面晋升杨廷麟显示自己大度，实际任命他为兵部主事（正六品），编入卢象升处赞画行营，逼他在大冬天离开京城遭遇军旅之苦。同时，巡抚张其平不发饷。又传说云、晋有敌情，于是有名的逃跑将军，大同总兵王朴借机离开卢象升逃走，害得卢象升只剩下杨国柱和虎大威两总兵。
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